穩轉株篩選實驗服務
一、實驗目的
穩轉株篩選實驗服務的主要目的是獲得能夠長期穩定表達特定基因或干擾特定基因表達的細胞系,以便于長期觀察和檢驗基因對細胞功能以及蛋白相互作用的影響。
二、實驗原理
通過將外源DNA/shRNA克隆到帶有某種抗性基因的載體上,重組載體轉染至宿主細胞并整合到其染色體中,并隨細胞分裂穩定傳遞。最后用載體中所含的抗性基因進行篩選,以獲得穩定表達目標基因的細胞株。
三、實驗步驟
?目標基因選擇?:
確定需要在細胞中穩定表達的目標基因。
構建質粒,將目標基因與抗性基因結合。
?載體選擇?:
使用能夠整合到宿主基因組中的載體,如慢病毒載體或逆轉錄病毒載體。
質粒載體也可用于實驗,但需要較高效的轉染方法和篩選策略。
?轉染方法?:
根據細胞類型選擇適合的轉染方法,如脂質體轉染、電穿孔等。
對于某些細胞,可能需要使用慢病毒或逆轉錄病毒感染。
?優化條件?:
優化轉染條件,包括DNA濃度、細胞密度和轉染試劑用量,以提高轉染效率。
確定適合的MOI(感染復數),以確保高效的基因整合和表達。
?篩選抗性基因?:
在轉染或感染后的24-48小時,添加選擇性抗生素或藥物(如G418、meifensuanzhi等),濃度需根據預先的滴定實驗確定。
篩選通常持續1-2周,直到未轉染的細胞被殺死,而轉染成功的細胞存活下來。
?稀釋單克隆篩選?:
如果需要獲取單克隆穩轉株,將篩選后的細胞進行極限稀釋,接種到96孔板中,每孔接種單個細胞。
待單細胞克隆長成小群體后,通過顯微鏡觀察并挑選生長良好的克隆進行進一步擴增。
?驗證表達?:
提取篩選后細胞的RNA和蛋白,通過qRT-PCR和Western blot檢測目標基因的mRNA和蛋白表達水平。
如果目標基因帶有熒光標簽(如GFP),可以通過熒光顯微鏡直接觀察表達和定位。
使用PCR或Southern blot檢測目標基因是否整合到宿主基因組中。
?細胞功能分析?:
根據研究目的,進行相關的功能實驗,如細胞增殖、凋亡、遷移等,驗證目標基因在穩轉株中的生物學功能。
?長期穩定性檢測?:
持續培養穩轉株,定期檢測目標基因的表達水平,評估其在長期培養中的穩定性。